Login

Join for Free!
17828 members
table of contents table of contents

Biology Articles » Biophysics » Molecular Biophysics » Electrostatics of nanosystems: Application to microtubules and the ribosome » References

References
- Electrostatics of nanosystems: Application to microtubules and the ribosome


1. Elcock, A. H. , Sept, D. & McCammon, J. A. (2001) J. Phys. Chem. B 105, 1504-1518.
2. Elcock, A. H. , Gabdoulline, R. R. , Wade, R. C. & McCammon, J. A. (1999) J. Mol. Biol. 291, 149-162.
3. Sept, D. , Elcock, A. H. & McCammon, J. A. (1999) J. Mol. Biol. 294, 1181-1189.
4. Davis, M. E. & McCammon, J. A. (1990) Chem. Rev. 94, 7684-7692.
5. Honig, B. & Nicholls, A. (1995) Science 268, 1144-1149.
6. Zahaur, R. J. & Morgan, R. S. (1988) J. Comput. Chem. 9, 171-187.
7. Zhou, H.-X. (1993) Biophys. J. 65, 955-963.
8. Vorobjev, Y. N. & Scheraga, H. A. (1997) J. Comput. Chem. 18, 569-583.
9. Holst, M. J. , Baker, N. A. & Wang, F. (2000) J. Comput. Chem. 21, 1319-1342.
10. Baker, N. A. , Holst, M. J. & Wang, F. (2000) J. Comput. Chem. 21, 1343-1352.
11. Cortis, C. M. & Friesner, R. A. (1997) J. Comput. Chem. 18, 1591-1608.
12. Holst, M. & Saied, F. (1995) J. Comput. Chem. 16, 337-364.
13. Davis, M. E. & McCammon, J. A. (1989) J. Comput. Chem. 10, 386-391.
14. Gilson, M. K. , Sharp, K. A. & Honig, B. H. (1987) J. Comput. Chem. 9, 327-335.
15. Baker, N. A. , Sept, D. , Holst, M. J. & McCammon, J. A. (2001) IBM J. Res. Dev. 45, 427-438.
16. Holst, M. & Saied, F. (1995) in Multigrid and Domain Decomposition Methods for Electrostatics Problems, eds. Keyes, D. E. & Xu, J. (Am. Math. Soc., Providence, RI).
17. Schwarz, H. A. (1869) J. für die reine und angewandte Mathematik 70, 105-120.
18. Bjørstad, P. E. & Widlund, O. B. (1986) Soc. Ind. Appl. Math. J. Num. Anal. 23, 1097-1120.
19. Van de Velde, E. F. (1994) Concurrent Scientific Computing (Springer, New York).
20. Ilin, A. , Bagheri, B. , Scott, L. R. , Briggs, J. M. & McCammon, J. A. (1995) Parallelization of Poisson-Boltzmann and Brownian Dynamics Calculations (Am. Chem. Soc., Washington, DC), pp. 170-185.
21. Tuminaro, R. S. & Womble, D. E. (1992) Analysis of the Multigrid FMV Cycle on Large-Scale Parallel Machines (Sandia National Laboratories, Albuquerque, NM), Technical Report SAND91-2199J.
22. Bank, R. & Holst, M. (2000) Soc. Ind. Appl. Math. J. Sci. Comput. 22, 1411-1443.
23. Holst, M. (2001) Adv. Comput. Math., in press.
24. Nogales, E. , Whittaker, M. , Milligan, R. A. & Downing, K. H. (1999) Cell 96, 79-88.
25. Walker, R. A. , O'Brien, E. T. , Pryer, N. K. , Soboeiro, M. F. , Voter, W. A. , Erikson, H. P. & Salmon, E. D. (1988) J. Cell. Biol. 107, 1437-1448.
26. Giannakakou, P. , Sackett, D. L. , Kang, Y.-K. , Zhan, Z. R. , Buters, J. T. M. , Fojo, T. & Poruchynsky, M. S. (1997) J. Biol. Chem. 272, 17118-17125.
27. Ban, N. , Nissen, P. , Hansen, J. , Moore, P. B. & Steitz, T. A. (2000) Science 289, 905-920.
28. Schluenzen, F. , Tocilj, A. , Zarivach, R. , Harms, J. , Gluehmann, M. , Janell, D. , Bashan, A. , Bartels, H. , Agmon, I. , Franceschi, F. & Yonath, A. (2000) Cell 102, 615-623.
29. Wimberly, B. T. , Brodersen, D. E. , Clemons, W. M. , Morgan-Warren, R. J. , Carter, A. P. , Vonrhein, C. , Hartsch, T. & Ramakrishnan, V. (2000) Nature (London) 407, 327-339.
30. Cate, J. H. , Yuspov, M. M. , Yusupova, G. Z. , Earnest, T. N. & Noller, H. F. (1999) Science 285, 2095-2104.
31. Culver, G. M. , Cate, J. H. , Yusupova, G. Z. , Yusupov, M. M. & Noller, H. F. (1999) Science 285, 2133-2135.
32. Klein, H. A & Ochoa, S. (1972) J. Biol. Chem. 247, 8122-8128.
33. Boublik, M. , Wydro, R. M. , Hellmann, W. & Jenkins, F. (1979) J. Supramol. Struct. 10, 397-404.
34. Carter, A. P. , Clemons, W. M. , Brodersen, D. E. , Morgan-Warren, R. J. , Wimberly, B. T. & Ramakrishnan, V. (2000) Nature (London) 407, 340-348.
35. Nissen, P. , Hansen, J. , Ban, N. , Moore, P. B. & Steitz, T. A. (2000) Science 289, 920-930.
36. Samaha, R. R. , Green, R. & Noller, H. F. (1995) Nature (London) 377, 309-314.

rating: 0.00 from 0 votes | updated on: 7 Dec 2007 | views: 428 |

Rate article:







excellent!bad…